法律分析：只要参保人到跨省定点医疗机构住院，出院时可在医院结算窗口直接结算，患者只需支付自付费用，新农合补偿费用由跨省定点医疗机构先行垫付。这些情况是不适用于新农合跨省就医联网结报，一是门诊就诊费用；二是因第三方责任导致意外伤害的住院医疗费用；三是不属于新农合报销范围的费用，以及其它不合理费用。
法律依据：《医疗保障基金使用监督管理条例》
第五条 县级以上应当加强对医疗保障基金使用监督管理工作的领导，建立健全医疗保障基金使用监督管理机制和基金监督管理执法，加强医疗保障基金使用监督管理能力建设，为医疗保障基金使用监督管理工作提供保障。
第六条 医疗保障行政部门主管全国的医疗保障基金使用监督管理工作。其他有关部门在各自职责范围内负责有关的医疗保障基金使用监督管理工作。
县级以上地方医疗保障行政部门负责本行政区域的医疗保障基金使用监督管理工作。县级以上地方其他有关部门在各自职责范围内负责有关的医疗保障基金使用监督管理工作。
